Biologisten näytekuvien hallinta

Yhteenveto artikkelista Crick, M.. 2005: Image File Management. In: Häuser et al. (eds.): Digital Imaging of Biological Type Specimens. A Manual of Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information: 41-55. Stuttgart. Saatavissa verkosta. Digitaalisten kuvatiedostojen hallinta on tärkeä osa biologisten näytteiden valokuvausprosessia. Hallinnassa tulee ottaa huomioon Kuvaformaatit Tiedostojen varastointi […]

Lue lisää »

Biologisten näytevalokuvien metadata

Yhteenveto artikkelista Morris, R. A. 2005: Image metadata standards and practices. In: Häuser et al. (eds.): Digital Imaging of Biological Type Specimens. A Manual of Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information: 19-34. Stuttgart. Saatavissa verkosta. Artikkeli antaa suosituksia tyyppinäytteistä otettavien valokuvien metadatasta: mitä tietoja kannattaa tallentaa ja mihin […]

Lue lisää »

Sähköiset tyypit (E-Types)

Yhteenveto artikkelista Speers, L.. 2005: E-Types – A New Resource for Taxonomic Research. In: Häuser et al. (eds.): Digital Imaging of Biological Type Specimens. A Manual of Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information: 13-18. Stuttgart. Saatavilla verkosta (PDF) Maailman eliölajeista on eri arvioiden mukaan tieteellisesti kuvaamatta 50–98 %. […]

Lue lisää »

Tyyppinäytteet verkkoon

Vapaamuotoinen yhteenveto artikkelista Häuser, C. L. & Scoble, Malcolm, J. 2005: Introduction. In: HÄUSER et al. (eds.): Digital Imaging of Biological Type Specimens. A Manual of Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information: 1-6. Stuttgart. Saatavilla verkosta. Taksonomia on tieteenala, joka järjestelee eliöitä hierarkkiseen ”sukupuuhun” niiden kehityshistorian mukaan. Tähän […]

Lue lisää »

Ruskaa, osa 2

Lisää värikkäitä ruskakuvia viikonloppuretkeltä mökille. Kun valo osuu sopivasti voimistuvat värit entisestään. Synkät sadepilvet ja järven pinta korostavat keltaista metsää. Maahan pudonneet lehdet alkavat kosteassa syyssäässä lahota nopeasti. Monessa paikassa maa oli täplikäs näistä pienistä koivunlehdillä kasvavista sienistä (ehkä ratasnahikas, Marasmium sp).

Lue lisää »

Älykkään taksonomisen tiedon välitys LSID:n ja RDF:n avulla

Tiivistelmä artikkelista Page, Roderic D. M. 2006: Taxonomic Names, Metadata, and the Semantic Web. Biodiversity Informatics, 3, 2006, pp. 1-15. [viitattu 2006-09-01] Nykyään on olemassa runsaasti erilaisia taksonomista tietoa käyttäviä tietokantoja. Ongelmana on että niiden käyttämä nimistö eroaa toisistaan ja jopa saman tietokannan sisällä (samasta lajista voidaan käyttää eri nimiä). Lisäksi tietokannat eivät yleensä ole […]

Lue lisää »

Ruskaa ja uusi kamera

Vanhan kameran (Canon EOS 300D) mentyä taas epäkuntoon vaihdoin toiseen malliin, käytössä nyt Canon Powershot S3 IS. Järjestelmäkameraan tottuneena jotkin ”hybridikameran” piirteistä oudoksuttavat, mutta hyviäkin puolia löytyy. Harrastajalle Powershotin laatu vaikuttaa riittävältä, ja järkkäriin verrattuna puolet halvempaan hintaan saa lisää ominaisuuksia (mm. kuvanvakain ja telezoom). Oman kokemukseni mukaan hankintahinta on digikameroiden kohdalla tärkeämpi piirre kuin […]

Lue lisää »

Nature of Santorini, Greece

Introduction Miscellaneous Information Birds A list of species observed Suggested birding locations Other animals Vegetation Nature Trails Santorini is a small volcanic island group in the Aiegean archipelago, Greece (see location and a local map). It consist of five islands: Thira (the main island, sometimes spelled Thera), Thirasia (Therasia), Aspronisi, Nea Kameni and Palea Kameni. The two […]

Lue lisää »

Life Science Identifiers (LSID)

(Jatkossa tämän jutun kaltaiset bioinformatiikkaan liittyvät tekniset artikkelit löytyvät aiheen bio-info alta. Bio-aiheen alla julkaisen luontoon, ympäristöön tai yleisbiologiaan liittyvät jutut. Voit halutessasi lukea vain yhtä aihealuetta RSS-virtana.) LSID on standardoitu URN (Uniform Resource Name) -protokolla (protocol, spesification, scheme), joka tarjoaa yksiselitteisen tavan erilaisten biologisten tietovarantojen (data resources) nimeämiseen ja tunnistamiseen. Jokaiselle nimettävälle kohteelle annetaan […]

Lue lisää »

Luontohavaintoja omille sivuillesi

Havaintoikkuna on Hatikka-luontohavaintopäiväkirjan uusi ominaisuus, joka antaa kenelle tahansa mahdollisuuden liittää Hatikan havaintoja omille verkkosivuilleen. Havainnot näkyvät reaaliaikaisesti: kun joku lisää havaintoja Hatikkaan, tulevat ne saman tien näkyviin myös sivuillasi olevaan havaintoikkunaan. Esimerkki toimivasta havaintoikkunasta on esim. biologia-sivuillani. Ikkunan kokoa voi itse muokata, samoin sitä mitä ikkunassa näkyy. Havaintoikkuna-ohjeiden, nimettyjen hakujen ja lajisuotimien avulla voit […]

Lue lisää »